14 мая была введена боевая готовность, когда почти все силы флота находились в ВМБ Александрия, за исключением фрегата «Рашид» и двух звеньев торпедных катеров, находящихся в Суэце. Одно звено торпедных катеров находилось в Порт-Саиде. Было отдано распоряжение командующего ВМФ за № 1 /68 об оперативном развертывании ВМС б то время, когда большая часть эсминцев и подводных лодок были неисправны и находились в ремонте.
Поступил приказ срочно закончить ремонт и подготовить их к действиям. Это привело к выводу из строя эсминца «Насер» 27 мая перед Александрией из-за поломки машин. Ввиду неудовлетворительного технического состояния эсминцев, находящихся в морской базе Александрии, невозможно было использовать их в серьезных действиях. Из-за отсутствия заранее составленного четкого плана приведения флота в боевую готовность стала отдаваться масса разноречивых приказов и распоряжений о рассредоточении кораблей в различных морских базах.
Все это делалось без учета обстановки и задач флота. С развитием кризиса в Акабском заливе все основные корабли, годные для ведения боевых действий, были выведены в Красное море, в то время как морские базы в Средиземном море были ослаблены. Все это привело к рассеиванию сил египетского флота и изоляции его отдельных частей друг от друга. 8 результате положение ВМС утром 5 июня было следующим. ВМБ Александрия: 3 эсминца, 2 фрегата — большинство этих кораблей неисправны (в ремонте, устаревшие) или исправно частично.