Низкий уровень руководства вооруженной борьбой на многих уровнях. Не было единого плана ведения войны, действия вооруженных сил воюющих государств не координировались, командование арабских армий не имело представления о характере «молниеносной» войны, а войска не были обучены для ее ведения. ТВД к войне не были хорошо подготовлены. Низкий уровень подготовки командиров всех степеней не смог обеспечить грамотного управления войсками в динамике скоротечного боя: разведывательные сведения о противнике запаздывали, войска запаздывали с выходом на указанные рубежи, решения принимались медленно, времени на организацию взаимодействия не оставалось, в войска с опозданием поступали задачи и боевые приказы.
Слабо было организовано взаимодействие между подразделениями и частями, родами войск и видами вооруженных сил. В результате израильской агрессии ближневосточный кризис еще более обострился. К почти миллионному числу беженцев в июне 1967 года прибавилось еще около 400 тыс. палестинцев, сирийцев и египтян. Сразу же после войны израильское правительство приступило к «освоению» захваченных земель с тем, чтобы в дальнейшем расширить за их счет свои границы. С весны 1969 года обстановка на линии прекращения огня стала напряженной, и военный конфликт получил название «война на истощение». В начале 70-х годов Израиль, получая поддержку американского империализма, продолжал агрессивную экспансионистскую политику по отношению к соседним арабским государствам, что привело к новой войне 1973 года.